潔凈實驗室有時候是單獨建設(shè)，有時候是整體實驗室建設(shè)的一部分。在潔凈實驗室這個區(qū)域，也可以分為潔凈區(qū)、準(zhǔn)潔凈區(qū)和輔助區(qū)三個部分。潔凈實驗室的設(shè)計規(guī)劃布局包括了平面布局、凈化路線、通風(fēng)管道線路。

潔凈實驗室平面設(shè)計規(guī)劃布局按照潔凈區(qū)、準(zhǔn)潔凈區(qū)和輔助區(qū)三個區(qū)域的位置不同進(jìn)行劃分規(guī)劃，可分為外廊環(huán)繞式、內(nèi)廊式、兩端式、核心式。

外廊環(huán)繞式的外廊可以有窗和無窗，兼作參觀和放置一些設(shè)備用，有的在外廊內(nèi)設(shè)值班采暖。外窗必須是雙層密封窗。

內(nèi)廊式：潔凈室設(shè)在外圍，而走廊設(shè)在內(nèi)部，這種走廊的潔凈度級別一般都較高，甚至和潔凈室同級。

兩端式：潔凈區(qū)設(shè)在一邊，另一邊設(shè)準(zhǔn)潔凈和輔助用房。

核心式：為了節(jié)約用地、縮短管線，可以潔凈區(qū)為核心，上下左右被各種輔助用房和隱蔽管道的空間包圍起來，這種方式避開室外氣候?qū)崈魠^(qū)的影響，減少了冷熱能耗，利于節(jié)能。